Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK5Q00535 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK5Q00535 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms