Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERV-K104P61576 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERV-K104P61576 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERV-K104P61576 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERV-K104P61576 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERV-K104P61576 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERV-K104P61576 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HERV-K104P61576 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HERV-K104P61576 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HERV-K104P61576 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERV-K104P61576 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms