Protein–RNA interactions for Protein: P11940

PABPC1, Polyadenylate-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1P11940 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PABPC1P11940 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms