Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BATF3Q9NR55 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms