Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GSDMCQ9BYG8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GSDMCQ9BYG8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
GSDMCQ9BYG8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GSDMCQ9BYG8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GSDMCQ9BYG8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GSDMCQ9BYG8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GSDMCQ9BYG8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GSDMCQ9BYG8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GSDMCQ9BYG8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GSDMCQ9BYG8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GSDMCQ9BYG8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GSDMCQ9BYG8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GSDMCQ9BYG8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GSDMCQ9BYG8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GSDMCQ9BYG8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GSDMCQ9BYG8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GSDMCQ9BYG8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GSDMCQ9BYG8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GSDMCQ9BYG8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GSDMCQ9BYG8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GSDMCQ9BYG8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GSDMCQ9BYG8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GSDMCQ9BYG8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GSDMCQ9BYG8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GSDMCQ9BYG8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GSDMCQ9BYG8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GSDMCQ9BYG8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GSDMCQ9BYG8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GSDMCQ9BYG8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GSDMCQ9BYG8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GSDMCQ9BYG8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GSDMCQ9BYG8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GSDMCQ9BYG8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GSDMCQ9BYG8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GSDMCQ9BYG8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GSDMCQ9BYG8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GSDMCQ9BYG8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GSDMCQ9BYG8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GSDMCQ9BYG8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
GSDMCQ9BYG8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GSDMCQ9BYG8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GSDMCQ9BYG8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GSDMCQ9BYG8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GSDMCQ9BYG8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GSDMCQ9BYG8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GSDMCQ9BYG8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GSDMCQ9BYG8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GSDMCQ9BYG8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GSDMCQ9BYG8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GSDMCQ9BYG8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GSDMCQ9BYG8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GSDMCQ9BYG8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GSDMCQ9BYG8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GSDMCQ9BYG8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GSDMCQ9BYG8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GSDMCQ9BYG8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GSDMCQ9BYG8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
GSDMCQ9BYG8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GSDMCQ9BYG8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GSDMCQ9BYG8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GSDMCQ9BYG8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms