Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CAPNS2Q96L46 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPNS2Q96L46 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
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