Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWQ0

RSBN1, Round spermatid basic protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSBN1Q5VWQ0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RSBN1Q5VWQ0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms