Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HIF1AQ16665 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIF1AQ16665 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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