Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PTPRKQ15262 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PTPRKQ15262 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PTPRKQ15262 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PTPRKQ15262 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PTPRKQ15262 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PTPRKQ15262 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PTPRKQ15262 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PTPRKQ15262 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PTPRKQ15262 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PTPRKQ15262 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PTPRKQ15262 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
PTPRKQ15262 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
PTPRKQ15262 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PTPRKQ15262 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PTPRKQ15262 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
PTPRKQ15262 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PTPRKQ15262 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PTPRKQ15262 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PTPRKQ15262 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PTPRKQ15262 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PTPRKQ15262 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PTPRKQ15262 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PTPRKQ15262 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
PTPRKQ15262 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
PTPRKQ15262 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
PTPRKQ15262 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PTPRKQ15262 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PTPRKQ15262 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PTPRKQ15262 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PTPRKQ15262 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PTPRKQ15262 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PTPRKQ15262 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
PTPRKQ15262 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
PTPRKQ15262 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PTPRKQ15262 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
PTPRKQ15262 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
PTPRKQ15262 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC33■■■□□ 2.87
PTPRKQ15262 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC33■■■□□ 2.87
PTPRKQ15262 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
PTPRKQ15262 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
PTPRKQ15262 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
PTPRKQ15262 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTPRKQ15262 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTPRKQ15262 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTPRKQ15262 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTPRKQ15262 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTPRKQ15262 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTPRKQ15262 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTPRKQ15262 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTPRKQ15262 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTPRKQ15262 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTPRKQ15262 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTPRKQ15262 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTPRKQ15262 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTPRKQ15262 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTPRKQ15262 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PTPRKQ15262 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PTPRKQ15262 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PTPRKQ15262 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
PTPRKQ15262 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PTPRKQ15262 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
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PTPRKQ15262 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PTPRKQ15262 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PTPRKQ15262 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PTPRKQ15262 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PTPRKQ15262 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PTPRKQ15262 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PTPRKQ15262 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PTPRKQ15262 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PTPRKQ15262 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PTPRKQ15262 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PTPRKQ15262 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PTPRKQ15262 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PTPRKQ15262 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PTPRKQ15262 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PTPRKQ15262 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PTPRKQ15262 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
PTPRKQ15262 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PTPRKQ15262 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
PTPRKQ15262 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PTPRKQ15262 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PTPRKQ15262 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PTPRKQ15262 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
PTPRKQ15262 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PTPRKQ15262 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PTPRKQ15262 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PTPRKQ15262 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PTPRKQ15262 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PTPRKQ15262 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PTPRKQ15262 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PTPRKQ15262 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PTPRKQ15262 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PTPRKQ15262 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PTPRKQ15262 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
PTPRKQ15262 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PTPRKQ15262 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PTPRKQ15262 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PTPRKQ15262 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
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