Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CUL4AQ13619 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CUL4AQ13619 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CUL4AQ13619 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CUL4AQ13619 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CUL4AQ13619 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CUL4AQ13619 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CUL4AQ13619 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CUL4AQ13619 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CUL4AQ13619 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CUL4AQ13619 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CUL4AQ13619 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CUL4AQ13619 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CUL4AQ13619 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CUL4AQ13619 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CUL4AQ13619 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
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