Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTP4A2Q12974 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTP4A2Q12974 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
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