Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMB4P28070 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms