Protein–RNA interactions for Protein: P21771

MRPS28, 37S ribosomal protein S28, mitochondrial, yeast

Predictions only

Length 286 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRPS28	P21771	YIL152W	YIL152W	708 nt		3.3	□□□□□ -1.88
MRPS28	P21771	YIL175W	YIL175W	318 nt		3.3	□□□□□ -1.88
MRPS28	P21771	YJL222W-B	YJL222W-B	138 nt		3.3	□□□□□ -1.88
MRPS28	P21771	SEC14	YMR079W	915 nt		3.3	□□□□□ -1.88
MRPS28	P21771	RPL20B	YOR312C	519 nt		3.3	□□□□□ -1.88
MRPS28	P21771	TAF3	YPL011C	1062 nt		3.3	□□□□□ -1.88
MRPS28	P21771	SYT1	YPR095C	3681 nt		3.3	□□□□□ -1.88
MRPS28	P21771	RSF2	YJR127C	4143 nt		3.29	□□□□□ -1.88
MRPS28	P21771	VAC17	YCL063W	1272 nt		3.29	□□□□□ -1.88
MRPS28	P21771	VMA22	YHR060W	546 nt		3.29	□□□□□ -1.88
MRPS28	P21771	SPC34	YKR037C	888 nt		3.29	□□□□□ -1.88
MRPS28	P21771	RPL18A	YOL120C	561 nt		3.29	□□□□□ -1.88
MRPS28	P21771	YOR008W-B	YOR008W-B	102 nt		3.29	□□□□□ -1.88
MRPS28	P21771	NRG2	YBR066C	663 nt		3.29	□□□□□ -1.88
MRPS28	P21771	PHO87	YCR037C	2772 nt		3.29	□□□□□ -1.88
MRPS28	P21771	ROK1	YGL171W	1695 nt		3.28	□□□□□ -1.88
MRPS28	P21771	IRC22	YEL001C	678 nt		3.28	□□□□□ -1.88
MRPS28	P21771	TMA19	YKL056C	504 nt		3.28	□□□□□ -1.88
MRPS28	P21771	URA4	YLR420W	1095 nt		3.28	□□□□□ -1.88
MRPS28	P21771	TPM1	YNL079C	600 nt		3.28	□□□□□ -1.88
MRPS28	P21771	ARR1	YPR199C	885 nt		3.28	□□□□□ -1.88
MRPS28	P21771	SOF1	YLL011W	1470 nt		3.28	□□□□□ -1.88
MRPS28	P21771	YDL176W	YDL176W	2127 nt		3.28	□□□□□ -1.89
MRPS28	P21771	RPA135	YPR010C	3612 nt		3.27	□□□□□ -1.89
MRPS28	P21771	DXO1	YDR370C	1329 nt		3.27	□□□□□ -1.89
MRPS28	P21771	CSM2	YIL132C	642 nt		3.27	□□□□□ -1.89
MRPS28	P21771	YML053C	YML053C	639 nt		3.27	□□□□□ -1.89
MRPS28	P21771	CCT7	YJL111W	1653 nt		3.27	□□□□□ -1.89
MRPS28	P21771	SIP1	YDR422C	2448 nt		3.27	□□□□□ -1.89
MRPS28	P21771	GIS4	YML006C	2325 nt		3.26	□□□□□ -1.89
MRPS28	P21771	DHH1	YDL160C	1521 nt		3.26	□□□□□ -1.89
MRPS28	P21771	YLR345W	YLR345W	1530 nt		3.26	□□□□□ -1.89
MRPS28	P21771	YEL074W	YEL074W	339 nt		3.26	□□□□□ -1.89
MRPS28	P21771	ATP12	YJL180C	978 nt		3.26	□□□□□ -1.89
MRPS28	P21771	REH1	YLR387C	1299 nt		3.26	□□□□□ -1.89
MRPS28	P21771	YMR294W-A	YMR294W-A	360 nt		3.26	□□□□□ -1.89
MRPS28	P21771	YIL092W	YIL092W	1902 nt		3.26	□□□□□ -1.89
MRPS28	P21771	SET4	YJL105W	1683 nt		3.26	□□□□□ -1.89
MRPS28	P21771	SRC1	YML034W	2505 nt		3.25	□□□□□ -1.89
MRPS28	P21771	RNA1	YMR235C	1224 nt		3.25	□□□□□ -1.89
MRPS28	P21771	TMC1	YOR052C	453 nt		3.25	□□□□□ -1.89
MRPS28	P21771	UBP14	YBR058C	2346 nt		3.25	□□□□□ -1.89
MRPS28	P21771	CWC2	YDL209C	1020 nt		3.24	□□□□□ -1.89
MRPS28	P21771	NOP6	YDL213C	678 nt		3.24	□□□□□ -1.89
MRPS28	P21771	CPR1	YDR155C	489 nt		3.24	□□□□□ -1.89
MRPS28	P21771	YGL262W	YGL262W	528 nt		3.24	□□□□□ -1.89
MRPS28	P21771	AHP1	YLR109W	531 nt		3.24	□□□□□ -1.89
MRPS28	P21771	PRM9	YAR031W	897 nt		3.24	□□□□□ -1.89
MRPS28	P21771	TPP1	YMR156C	717 nt		3.24	□□□□□ -1.89
MRPS28	P21771	MRPL24	YMR193W	777 nt		3.24	□□□□□ -1.89
MRPS28	P21771	POC4	YPL144W	447 nt		3.24	□□□□□ -1.89
MRPS28	P21771	HUT1	YPL244C	1020 nt		3.24	□□□□□ -1.89
MRPS28	P21771	SPT16	YGL207W	3108 nt		3.24	□□□□□ -1.89
MRPS28	P21771	YLR278C	YLR278C	4026 nt		3.23	□□□□□ -1.89
MRPS28	P21771	DEG1	YFL001W	1329 nt		3.23	□□□□□ -1.89
MRPS28	P21771	PRS5	YOL061W	1491 nt		3.23	□□□□□ -1.89
MRPS28	P21771	DBP7	YKR024C	2229 nt		3.23	□□□□□ -1.89
MRPS28	P21771	YFL051C	YFL051C	483 nt		3.23	□□□□□ -1.89
MRPS28	P21771	LST7	YGR057C	729 nt		3.23	□□□□□ -1.89
MRPS28	P21771	PHO12	YHR215W	1404 nt		3.23	□□□□□ -1.89
MRPS28	P21771	PHO11	YAR071W	1404 nt		3.23	□□□□□ -1.89
MRPS28	P21771	OPY1	YBR129C	987 nt		3.23	□□□□□ -1.89
MRPS28	P21771	SIR2	YDL042C	1689 nt		3.23	□□□□□ -1.89
MRPS28	P21771	BNA4	YBL098W	1383 nt		3.23	□□□□□ -1.89
MRPS28	P21771	NAM9	YNL137C	1461 nt		3.22	□□□□□ -1.89
MRPS28	P21771	YBR138C	YBR138C	1575 nt		3.22	□□□□□ -1.89
MRPS28	P21771	AIP1	YMR092C	1848 nt		3.22	□□□□□ -1.89
MRPS28	P21771	INP52	YNL106C	3552 nt		3.22	□□□□□ -1.89
MRPS28	P21771	MSW1	YDR268W	1140 nt		3.22	□□□□□ -1.89
MRPS28	P21771	YEL028W	YEL028W	462 nt		3.22	□□□□□ -1.89
MRPS28	P21771	RSM25	YIL093C	795 nt		3.22	□□□□□ -1.89
MRPS28	P21771	YPL162C	YPL162C	822 nt		3.22	□□□□□ -1.89
MRPS28	P21771	SSL1	YLR005W	1386 nt		3.22	□□□□□ -1.89
MRPS28	P21771	RSC1	YGR056W	2787 nt		3.22	□□□□□ -1.89
MRPS28	P21771	PRR2	YDL214C	2100 nt		3.22	□□□□□ -1.89
MRPS28	P21771	GLO3	YER122C	1482 nt		3.22	□□□□□ -1.89
MRPS28	P21771	GWT1	YJL091C	1473 nt		3.22	□□□□□ -1.89
MRPS28	P21771	IMG2	YCR071C	441 nt		3.21	□□□□□ -1.9
MRPS28	P21771	YGL193C	YGL193C	312 nt		3.21	□□□□□ -1.9
MRPS28	P21771	DOG2	YHR043C	741 nt		3.21	□□□□□ -1.9
MRPS28	P21771	YHR173C	YHR173C	339 nt		3.21	□□□□□ -1.9
MRPS28	P21771	ASI2	YNL159C	870 nt		3.21	□□□□□ -1.9
MRPS28	P21771	PCI8	YIL071C	1335 nt		3.2	□□□□□ -1.9
MRPS28	P21771	CIN8	YEL061C	3003 nt		3.2	□□□□□ -1.9
MRPS28	P21771	ROM1	YGR070W	3468 nt		3.2	□□□□□ -1.9
MRPS28	P21771	PWP2	YCR057C	2772 nt		3.2	□□□□□ -1.9
MRPS28	P21771	CEX1	YOR112W	2286 nt		3.2	□□□□□ -1.9
MRPS28	P21771	YDR133C	YDR133C	336 nt		3.2	□□□□□ -1.9
MRPS28	P21771	IES6	YEL044W	501 nt		3.2	□□□□□ -1.9
MRPS28	P21771	CNN1	YFR046C	1086 nt		3.2	□□□□□ -1.9
MRPS28	P21771	RPS0A	YGR214W	759 nt		3.2	□□□□□ -1.9
MRPS28	P21771	FUR1	YHR128W	651 nt		3.2	□□□□□ -1.9
MRPS28	P21771	YBR300C	YBR300C	498 nt		3.2	□□□□□ -1.9
MRPS28	P21771	ATG13	YPR185W	2217 nt		3.2	□□□□□ -1.9
MRPS28	P21771	UBP5	YER144C	2418 nt		3.2	□□□□□ -1.9
MRPS28	P21771	ETP1	YHL010C	1758 nt		3.2	□□□□□ -1.9
MRPS28	P21771	WHI4	YDL224C	1950 nt		3.2	□□□□□ -1.9
MRPS28	P21771	YKL050C	YKL050C	2769 nt		3.19	□□□□□ -1.9
MRPS28	P21771	FLD1	YLR404W	858 nt		3.19	□□□□□ -1.9
MRPS28	P21771	FOL3	YMR113W	1284 nt		3.19	□□□□□ -1.9

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