Protein–RNA interactions for Protein: A6NM62

LRRC53, Leucine-rich repeat-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC53A6NM62 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC53A6NM62 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC53A6NM62 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC53A6NM62 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC53A6NM62 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC53A6NM62 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC53A6NM62 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC53A6NM62 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC53A6NM62 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC53A6NM62 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC53A6NM62 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC53A6NM62 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC53A6NM62 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRRC53A6NM62 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRC53A6NM62 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC53A6NM62 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms