Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y252

RNF6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF6Q9Y252 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RNF6Q9Y252 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms