Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ1

ERGIC2, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC2Q96RQ1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERGIC2Q96RQ1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERGIC2Q96RQ1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERGIC2Q96RQ1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERGIC2Q96RQ1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERGIC2Q96RQ1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERGIC2Q96RQ1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERGIC2Q96RQ1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ERGIC2Q96RQ1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERGIC2Q96RQ1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERGIC2Q96RQ1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERGIC2Q96RQ1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ERGIC2Q96RQ1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ERGIC2Q96RQ1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ERGIC2Q96RQ1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERGIC2Q96RQ1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERGIC2Q96RQ1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERGIC2Q96RQ1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERGIC2Q96RQ1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERGIC2Q96RQ1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERGIC2Q96RQ1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERGIC2Q96RQ1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERGIC2Q96RQ1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERGIC2Q96RQ1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERGIC2Q96RQ1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERGIC2Q96RQ1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERGIC2Q96RQ1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERGIC2Q96RQ1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERGIC2Q96RQ1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERGIC2Q96RQ1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERGIC2Q96RQ1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERGIC2Q96RQ1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERGIC2Q96RQ1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ERGIC2Q96RQ1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERGIC2Q96RQ1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERGIC2Q96RQ1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERGIC2Q96RQ1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERGIC2Q96RQ1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERGIC2Q96RQ1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERGIC2Q96RQ1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERGIC2Q96RQ1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERGIC2Q96RQ1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERGIC2Q96RQ1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERGIC2Q96RQ1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERGIC2Q96RQ1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERGIC2Q96RQ1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERGIC2Q96RQ1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERGIC2Q96RQ1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ERGIC2Q96RQ1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ERGIC2Q96RQ1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERGIC2Q96RQ1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERGIC2Q96RQ1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERGIC2Q96RQ1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERGIC2Q96RQ1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERGIC2Q96RQ1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERGIC2Q96RQ1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERGIC2Q96RQ1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERGIC2Q96RQ1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERGIC2Q96RQ1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERGIC2Q96RQ1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERGIC2Q96RQ1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERGIC2Q96RQ1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERGIC2Q96RQ1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERGIC2Q96RQ1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERGIC2Q96RQ1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERGIC2Q96RQ1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERGIC2Q96RQ1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERGIC2Q96RQ1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERGIC2Q96RQ1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERGIC2Q96RQ1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERGIC2Q96RQ1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERGIC2Q96RQ1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERGIC2Q96RQ1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERGIC2Q96RQ1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERGIC2Q96RQ1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERGIC2Q96RQ1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ERGIC2Q96RQ1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERGIC2Q96RQ1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERGIC2Q96RQ1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERGIC2Q96RQ1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERGIC2Q96RQ1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERGIC2Q96RQ1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERGIC2Q96RQ1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERGIC2Q96RQ1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERGIC2Q96RQ1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERGIC2Q96RQ1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERGIC2Q96RQ1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ERGIC2Q96RQ1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERGIC2Q96RQ1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERGIC2Q96RQ1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERGIC2Q96RQ1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERGIC2Q96RQ1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERGIC2Q96RQ1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ERGIC2Q96RQ1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERGIC2Q96RQ1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERGIC2Q96RQ1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERGIC2Q96RQ1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERGIC2Q96RQ1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERGIC2Q96RQ1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERGIC2Q96RQ1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms