Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BHLHA9Q7RTU4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms