Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
SHROOM2Q13796 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
SHROOM2Q13796 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
SHROOM2Q13796 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
SHROOM2Q13796 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
SHROOM2Q13796 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
SHROOM2Q13796 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
SHROOM2Q13796 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
SHROOM2Q13796 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
SHROOM2Q13796 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
SHROOM2Q13796 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
SHROOM2Q13796 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SHROOM2Q13796 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
SHROOM2Q13796 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
SHROOM2Q13796 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SHROOM2Q13796 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
SHROOM2Q13796 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
SHROOM2Q13796 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
SHROOM2Q13796 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
SHROOM2Q13796 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
SHROOM2Q13796 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SHROOM2Q13796 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
SHROOM2Q13796 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
SHROOM2Q13796 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SHROOM2Q13796 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SHROOM2Q13796 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SHROOM2Q13796 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SHROOM2Q13796 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
SHROOM2Q13796 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
SHROOM2Q13796 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
SHROOM2Q13796 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.25
SHROOM2Q13796 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC35.32■■■■□ 3.25
SHROOM2Q13796 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
SHROOM2Q13796 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC35.32■■■■□ 3.25
SHROOM2Q13796 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
SHROOM2Q13796 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
SHROOM2Q13796 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
SHROOM2Q13796 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
SHROOM2Q13796 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
SHROOM2Q13796 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
SHROOM2Q13796 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
SHROOM2Q13796 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
SHROOM2Q13796 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
SHROOM2Q13796 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
SHROOM2Q13796 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
SHROOM2Q13796 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
SHROOM2Q13796 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
SHROOM2Q13796 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
SHROOM2Q13796 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
SHROOM2Q13796 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SHROOM2Q13796 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SHROOM2Q13796 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
SHROOM2Q13796 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
SHROOM2Q13796 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SHROOM2Q13796 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SHROOM2Q13796 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SHROOM2Q13796 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SHROOM2Q13796 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SHROOM2Q13796 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SHROOM2Q13796 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SHROOM2Q13796 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SHROOM2Q13796 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SHROOM2Q13796 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
SHROOM2Q13796 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
SHROOM2Q13796 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
SHROOM2Q13796 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
SHROOM2Q13796 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
SHROOM2Q13796 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
SHROOM2Q13796 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
SHROOM2Q13796 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
SHROOM2Q13796 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
SHROOM2Q13796 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
SHROOM2Q13796 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
SHROOM2Q13796 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
SHROOM2Q13796 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
SHROOM2Q13796 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
SHROOM2Q13796 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
SHROOM2Q13796 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
SHROOM2Q13796 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
SHROOM2Q13796 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
SHROOM2Q13796 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
SHROOM2Q13796 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SHROOM2Q13796 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SHROOM2Q13796 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
SHROOM2Q13796 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SHROOM2Q13796 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SHROOM2Q13796 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SHROOM2Q13796 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
SHROOM2Q13796 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
SHROOM2Q13796 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
SHROOM2Q13796 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SHROOM2Q13796 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
SHROOM2Q13796 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
SHROOM2Q13796 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
SHROOM2Q13796 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SHROOM2Q13796 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
SHROOM2Q13796 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SHROOM2Q13796 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
SHROOM2Q13796 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
SHROOM2Q13796 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
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