Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RUNX3Q13761 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUNX3Q13761 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
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