Protein–RNA interactions for Protein: Q02962

PAX2, Paired box protein Pax-2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX2Q02962 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PAX2Q02962 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms