Protein–RNA interactions for Protein: P38919

EIF4A3, Eukaryotic initiation factor 4A-III, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A3P38919 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EIF4A3P38919 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms