Protein–RNA interactions for Protein: P12319

FCER1A, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCER1AP12319 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FCER1AP12319 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FCER1AP12319 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FCER1AP12319 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
FCER1AP12319 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FCER1AP12319 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FCER1AP12319 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FCER1AP12319 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FCER1AP12319 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FCER1AP12319 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FCER1AP12319 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FCER1AP12319 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FCER1AP12319 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FCER1AP12319 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FCER1AP12319 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FCER1AP12319 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FCER1AP12319 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FCER1AP12319 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FCER1AP12319 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FCER1AP12319 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FCER1AP12319 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FCER1AP12319 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FCER1AP12319 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FCER1AP12319 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FCER1AP12319 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
FCER1AP12319 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FCER1AP12319 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FCER1AP12319 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FCER1AP12319 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms