Protein–RNA interactions for Protein: P11940

PABPC1, Polyadenylate-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1P11940 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms