Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
IGSF3O75054 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
IGSF3O75054 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
IGSF3O75054 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
IGSF3O75054 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
IGSF3O75054 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
IGSF3O75054 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
IGSF3O75054 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
IGSF3O75054 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
IGSF3O75054 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IGSF3O75054 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IGSF3O75054 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
IGSF3O75054 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IGSF3O75054 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
IGSF3O75054 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
IGSF3O75054 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
IGSF3O75054 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IGSF3O75054 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IGSF3O75054 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
IGSF3O75054 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IGSF3O75054 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IGSF3O75054 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IGSF3O75054 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
IGSF3O75054 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IGSF3O75054 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
IGSF3O75054 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
IGSF3O75054 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
IGSF3O75054 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
IGSF3O75054 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
IGSF3O75054 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
IGSF3O75054 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IGSF3O75054 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IGSF3O75054 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IGSF3O75054 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
IGSF3O75054 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
IGSF3O75054 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
IGSF3O75054 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
IGSF3O75054 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
IGSF3O75054 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
IGSF3O75054 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
IGSF3O75054 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
IGSF3O75054 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
IGSF3O75054 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
IGSF3O75054 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
IGSF3O75054 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
IGSF3O75054 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
IGSF3O75054 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
IGSF3O75054 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
IGSF3O75054 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
IGSF3O75054 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
IGSF3O75054 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
IGSF3O75054 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
IGSF3O75054 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
IGSF3O75054 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
IGSF3O75054 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
IGSF3O75054 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
IGSF3O75054 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
IGSF3O75054 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
IGSF3O75054 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
IGSF3O75054 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IGSF3O75054 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IGSF3O75054 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
IGSF3O75054 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IGSF3O75054 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
IGSF3O75054 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
IGSF3O75054 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
IGSF3O75054 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
IGSF3O75054 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
IGSF3O75054 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
IGSF3O75054 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
IGSF3O75054 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
IGSF3O75054 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
IGSF3O75054 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
IGSF3O75054 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms