Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ6

PARP9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP9Q8IXQ6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PARP9Q8IXQ6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PARP9Q8IXQ6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms