Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL19A1Q14993 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL19A1Q14993 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL19A1Q14993 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL19A1Q14993 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL19A1Q14993 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL19A1Q14993 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL19A1Q14993 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
COL19A1Q14993 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL19A1Q14993 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL19A1Q14993 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23■■□□□ 1.27
COL19A1Q14993 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
COL19A1Q14993 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
COL19A1Q14993 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL19A1Q14993 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COL19A1Q14993 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL19A1Q14993 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL19A1Q14993 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL19A1Q14993 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL19A1Q14993 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL19A1Q14993 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
COL19A1Q14993 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL19A1Q14993 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL19A1Q14993 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL19A1Q14993 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL19A1Q14993 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL19A1Q14993 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL19A1Q14993 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL19A1Q14993 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL19A1Q14993 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL19A1Q14993 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL19A1Q14993 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL19A1Q14993 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL19A1Q14993 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL19A1Q14993 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL19A1Q14993 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL19A1Q14993 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL19A1Q14993 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL19A1Q14993 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL19A1Q14993 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL19A1Q14993 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL19A1Q14993 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL19A1Q14993 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL19A1Q14993 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL19A1Q14993 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL19A1Q14993 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL19A1Q14993 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL19A1Q14993 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL19A1Q14993 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
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