Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
GRIN2AQ12879 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
GRIN2AQ12879 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
GRIN2AQ12879 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
GRIN2AQ12879 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
GRIN2AQ12879 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
GRIN2AQ12879 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
GRIN2AQ12879 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
GRIN2AQ12879 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.35
GRIN2AQ12879 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
GRIN2AQ12879 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
GRIN2AQ12879 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
GRIN2AQ12879 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
GRIN2AQ12879 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
GRIN2AQ12879 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC36■■■■□ 3.35
GRIN2AQ12879 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
GRIN2AQ12879 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36■■■■□ 3.35
GRIN2AQ12879 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
GRIN2AQ12879 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
GRIN2AQ12879 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
GRIN2AQ12879 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
GRIN2AQ12879 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
GRIN2AQ12879 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
GRIN2AQ12879 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
GRIN2AQ12879 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
GRIN2AQ12879 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
GRIN2AQ12879 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
GRIN2AQ12879 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
GRIN2AQ12879 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC35.99■■■■□ 3.35
GRIN2AQ12879 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
GRIN2AQ12879 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
GRIN2AQ12879 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
GRIN2AQ12879 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
GRIN2AQ12879 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
GRIN2AQ12879 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
GRIN2AQ12879 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
GRIN2AQ12879 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
GRIN2AQ12879 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
GRIN2AQ12879 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
GRIN2AQ12879 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
GRIN2AQ12879 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
GRIN2AQ12879 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
GRIN2AQ12879 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
GRIN2AQ12879 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
GRIN2AQ12879 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
GRIN2AQ12879 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
GRIN2AQ12879 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
GRIN2AQ12879 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
GRIN2AQ12879 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
GRIN2AQ12879 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
GRIN2AQ12879 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
GRIN2AQ12879 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
GRIN2AQ12879 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
GRIN2AQ12879 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
GRIN2AQ12879 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC35.95■■■■□ 3.34
GRIN2AQ12879 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
GRIN2AQ12879 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
GRIN2AQ12879 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
GRIN2AQ12879 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
GRIN2AQ12879 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
GRIN2AQ12879 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
GRIN2AQ12879 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
GRIN2AQ12879 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
GRIN2AQ12879 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
GRIN2AQ12879 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
GRIN2AQ12879 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
GRIN2AQ12879 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
GRIN2AQ12879 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
GRIN2AQ12879 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
GRIN2AQ12879 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
GRIN2AQ12879 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC35.92■■■■□ 3.34
GRIN2AQ12879 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
GRIN2AQ12879 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
GRIN2AQ12879 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
GRIN2AQ12879 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
GRIN2AQ12879 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
GRIN2AQ12879 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
GRIN2AQ12879 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
GRIN2AQ12879 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
GRIN2AQ12879 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
GRIN2AQ12879 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
GRIN2AQ12879 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
GRIN2AQ12879 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
GRIN2AQ12879 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
GRIN2AQ12879 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
GRIN2AQ12879 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
GRIN2AQ12879 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
GRIN2AQ12879 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
GRIN2AQ12879 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
GRIN2AQ12879 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
GRIN2AQ12879 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
GRIN2AQ12879 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
GRIN2AQ12879 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
GRIN2AQ12879 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
GRIN2AQ12879 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
GRIN2AQ12879 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
GRIN2AQ12879 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
GRIN2AQ12879 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
GRIN2AQ12879 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
GRIN2AQ12879 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
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