Protein–RNA interactions for Protein: P59025

RTP1, Receptor-transporting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP1P59025 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTP1P59025 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTP1P59025 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTP1P59025 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTP1P59025 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTP1P59025 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTP1P59025 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTP1P59025 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTP1P59025 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTP1P59025 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTP1P59025 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTP1P59025 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTP1P59025 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTP1P59025 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTP1P59025 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTP1P59025 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTP1P59025 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTP1P59025 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTP1P59025 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTP1P59025 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTP1P59025 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTP1P59025 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTP1P59025 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTP1P59025 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTP1P59025 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTP1P59025 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTP1P59025 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTP1P59025 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTP1P59025 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTP1P59025 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTP1P59025 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTP1P59025 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTP1P59025 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTP1P59025 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTP1P59025 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTP1P59025 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTP1P59025 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTP1P59025 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTP1P59025 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTP1P59025 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTP1P59025 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTP1P59025 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RTP1P59025 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTP1P59025 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTP1P59025 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTP1P59025 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTP1P59025 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTP1P59025 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTP1P59025 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTP1P59025 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTP1P59025 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RTP1P59025 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTP1P59025 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTP1P59025 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTP1P59025 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTP1P59025 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTP1P59025 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTP1P59025 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTP1P59025 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RTP1P59025 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTP1P59025 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RTP1P59025 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTP1P59025 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTP1P59025 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTP1P59025 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTP1P59025 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RTP1P59025 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTP1P59025 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTP1P59025 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTP1P59025 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RTP1P59025 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTP1P59025 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTP1P59025 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RTP1P59025 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTP1P59025 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTP1P59025 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTP1P59025 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTP1P59025 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTP1P59025 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTP1P59025 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTP1P59025 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTP1P59025 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTP1P59025 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTP1P59025 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTP1P59025 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTP1P59025 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTP1P59025 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTP1P59025 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTP1P59025 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTP1P59025 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTP1P59025 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RTP1P59025 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTP1P59025 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RTP1P59025 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTP1P59025 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RTP1P59025 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RTP1P59025 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RTP1P59025 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTP1P59025 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTP1P59025 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms