Protein–RNA interactions for Protein: E7EW31

PROB1, Proline-rich basic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROB1E7EW31 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PROB1E7EW31 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PROB1E7EW31 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms