Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLF12Q9Y4X4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.5 ms