Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN3Q16667 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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