Protein–RNA interactions for Protein: Q12965

MYO1E, Unconventional myosin-Ie, humanhuman

Predictions only

Length 1,108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1EQ12965 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MYO1EQ12965 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MYO1EQ12965 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MYO1EQ12965 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MYO1EQ12965 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MYO1EQ12965 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MYO1EQ12965 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYO1EQ12965 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYO1EQ12965 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MYO1EQ12965 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYO1EQ12965 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYO1EQ12965 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYO1EQ12965 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYO1EQ12965 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYO1EQ12965 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYO1EQ12965 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYO1EQ12965 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYO1EQ12965 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYO1EQ12965 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYO1EQ12965 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYO1EQ12965 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYO1EQ12965 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYO1EQ12965 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYO1EQ12965 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYO1EQ12965 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYO1EQ12965 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYO1EQ12965 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYO1EQ12965 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYO1EQ12965 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYO1EQ12965 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYO1EQ12965 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYO1EQ12965 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYO1EQ12965 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYO1EQ12965 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYO1EQ12965 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYO1EQ12965 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYO1EQ12965 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYO1EQ12965 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYO1EQ12965 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYO1EQ12965 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYO1EQ12965 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MYO1EQ12965 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYO1EQ12965 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYO1EQ12965 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYO1EQ12965 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYO1EQ12965 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYO1EQ12965 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYO1EQ12965 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYO1EQ12965 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYO1EQ12965 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MYO1EQ12965 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYO1EQ12965 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYO1EQ12965 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYO1EQ12965 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYO1EQ12965 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYO1EQ12965 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MYO1EQ12965 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MYO1EQ12965 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MYO1EQ12965 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYO1EQ12965 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYO1EQ12965 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYO1EQ12965 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYO1EQ12965 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYO1EQ12965 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYO1EQ12965 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYO1EQ12965 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYO1EQ12965 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYO1EQ12965 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYO1EQ12965 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYO1EQ12965 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYO1EQ12965 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYO1EQ12965 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYO1EQ12965 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYO1EQ12965 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYO1EQ12965 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYO1EQ12965 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYO1EQ12965 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYO1EQ12965 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYO1EQ12965 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYO1EQ12965 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYO1EQ12965 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYO1EQ12965 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYO1EQ12965 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYO1EQ12965 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYO1EQ12965 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYO1EQ12965 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYO1EQ12965 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYO1EQ12965 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYO1EQ12965 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYO1EQ12965 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYO1EQ12965 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MYO1EQ12965 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYO1EQ12965 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYO1EQ12965 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYO1EQ12965 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYO1EQ12965 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYO1EQ12965 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYO1EQ12965 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYO1EQ12965 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYO1EQ12965 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms