Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SREBF2Q12772 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
SREBF2Q12772 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SREBF2Q12772 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SREBF2Q12772 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SREBF2Q12772 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SREBF2Q12772 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SREBF2Q12772 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SREBF2Q12772 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SREBF2Q12772 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SREBF2Q12772 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SREBF2Q12772 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SREBF2Q12772 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SREBF2Q12772 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SREBF2Q12772 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SREBF2Q12772 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SREBF2Q12772 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SREBF2Q12772 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SREBF2Q12772 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SREBF2Q12772 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SREBF2Q12772 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SREBF2Q12772 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SREBF2Q12772 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SREBF2Q12772 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SREBF2Q12772 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SREBF2Q12772 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SREBF2Q12772 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SREBF2Q12772 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SREBF2Q12772 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SREBF2Q12772 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SREBF2Q12772 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SREBF2Q12772 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SREBF2Q12772 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SREBF2Q12772 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SREBF2Q12772 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SREBF2Q12772 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SREBF2Q12772 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SREBF2Q12772 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SREBF2Q12772 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SREBF2Q12772 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SREBF2Q12772 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SREBF2Q12772 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SREBF2Q12772 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SREBF2Q12772 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SREBF2Q12772 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SREBF2Q12772 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SREBF2Q12772 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SREBF2Q12772 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SREBF2Q12772 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SREBF2Q12772 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SREBF2Q12772 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SREBF2Q12772 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SREBF2Q12772 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SREBF2Q12772 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
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