Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE1BQ01064 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE1BQ01064 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms