Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERCC5P28715 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERCC5P28715 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERCC5P28715 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERCC5P28715 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERCC5P28715 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERCC5P28715 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERCC5P28715 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERCC5P28715 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERCC5P28715 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERCC5P28715 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERCC5P28715 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERCC5P28715 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERCC5P28715 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERCC5P28715 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERCC5P28715 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERCC5P28715 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERCC5P28715 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERCC5P28715 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERCC5P28715 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERCC5P28715 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERCC5P28715 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ERCC5P28715 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERCC5P28715 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERCC5P28715 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERCC5P28715 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERCC5P28715 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERCC5P28715 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERCC5P28715 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ERCC5P28715 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERCC5P28715 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERCC5P28715 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERCC5P28715 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ERCC5P28715 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ERCC5P28715 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
ERCC5P28715 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERCC5P28715 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERCC5P28715 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERCC5P28715 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERCC5P28715 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERCC5P28715 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERCC5P28715 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ERCC5P28715 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERCC5P28715 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERCC5P28715 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERCC5P28715 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERCC5P28715 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERCC5P28715 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERCC5P28715 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERCC5P28715 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERCC5P28715 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERCC5P28715 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERCC5P28715 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERCC5P28715 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERCC5P28715 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERCC5P28715 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERCC5P28715 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERCC5P28715 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ERCC5P28715 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERCC5P28715 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERCC5P28715 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERCC5P28715 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERCC5P28715 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERCC5P28715 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERCC5P28715 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERCC5P28715 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERCC5P28715 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERCC5P28715 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERCC5P28715 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ERCC5P28715 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERCC5P28715 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERCC5P28715 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERCC5P28715 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ERCC5P28715 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERCC5P28715 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERCC5P28715 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERCC5P28715 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERCC5P28715 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERCC5P28715 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERCC5P28715 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERCC5P28715 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERCC5P28715 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERCC5P28715 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERCC5P28715 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERCC5P28715 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERCC5P28715 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERCC5P28715 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERCC5P28715 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERCC5P28715 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERCC5P28715 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERCC5P28715 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERCC5P28715 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERCC5P28715 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ERCC5P28715 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERCC5P28715 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERCC5P28715 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERCC5P28715 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERCC5P28715 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERCC5P28715 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms