Protein–RNA interactions for Protein: P02381

VAR1, Ribosomal protein VAR1, mitochondrial, yeast

Predictions only

Length 398 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VAR1	P02381	POC4	YPL144W	447 nt		2.96	□□□□□ -1.94
VAR1	P02381	IMD4	YML056C	1575 nt		2.95	□□□□□ -1.94
VAR1	P02381	FUN12	YAL035W	3009 nt		2.95	□□□□□ -1.94
VAR1	P02381	RAD4	YER162C	2265 nt		2.95	□□□□□ -1.94
VAR1	P02381	MGT1	YDL200C	567 nt		2.95	□□□□□ -1.94
VAR1	P02381	NOP6	YDL213C	678 nt		2.95	□□□□□ -1.94
VAR1	P02381	YDL228C	YDL228C	642 nt		2.95	□□□□□ -1.94
VAR1	P02381	AIM7	YDR063W	450 nt		2.95	□□□□□ -1.94
VAR1	P02381	YHR145C	YHR145C	357 nt		2.95	□□□□□ -1.94
VAR1	P02381	YJL211C	YJL211C	444 nt		2.95	□□□□□ -1.94
VAR1	P02381	YML116W-A	YML116W-A	303 nt		2.95	□□□□□ -1.94
VAR1	P02381	COS3	YML132W	1140 nt		2.95	□□□□□ -1.94
VAR1	P02381	COS2	YBR302C	1140 nt		2.95	□□□□□ -1.94
VAR1	P02381	USA1	YML029W	2517 nt		2.95	□□□□□ -1.94
VAR1	P02381	NTA1	YJR062C	1374 nt		2.95	□□□□□ -1.94
VAR1	P02381	YLR345W	YLR345W	1530 nt		2.94	□□□□□ -1.94
VAR1	P02381	NGL3	YML118W	1518 nt		2.94	□□□□□ -1.94
VAR1	P02381	TAF10	YDR167W	621 nt		2.94	□□□□□ -1.94
VAR1	P02381	RSM25	YIL093C	795 nt		2.94	□□□□□ -1.94
VAR1	P02381	EOS1	YNL080C	1101 nt		2.94	□□□□□ -1.94
VAR1	P02381	RPC34	YNR003C	954 nt		2.94	□□□□□ -1.94
VAR1	P02381	STB3	YDR169C	1542 nt		2.93	□□□□□ -1.94
VAR1	P02381	TIP20	YGL145W	2106 nt		2.93	□□□□□ -1.94
VAR1	P02381	TMA17	YDL110C	453 nt		2.93	□□□□□ -1.94
VAR1	P02381	YGL074C	YGL074C	327 nt		2.93	□□□□□ -1.94
VAR1	P02381	YIR040C	YIR040C	333 nt		2.93	□□□□□ -1.94
VAR1	P02381	ANB1	YJR047C	474 nt		2.93	□□□□□ -1.94
VAR1	P02381	ECM2	YBR065C	1095 nt		2.93	□□□□□ -1.94
VAR1	P02381	FAT1	YBR041W	2010 nt		2.93	□□□□□ -1.94
VAR1	P02381	TSR1	YDL060W	2367 nt		2.93	□□□□□ -1.94
VAR1	P02381	APM4	YOL062C	1476 nt		2.92	□□□□□ -1.94
VAR1	P02381	GSC2	YGR032W	5688 nt		2.92	□□□□□ -1.94
VAR1	P02381	HIS5	YIL116W	1158 nt		2.92	□□□□□ -1.94
VAR1	P02381	RAD14	YMR201C	1116 nt		2.92	□□□□□ -1.94
VAR1	P02381	TRI1	YMR233W	681 nt		2.92	□□□□□ -1.94
VAR1	P02381	LDS2	YOL047C	1071 nt		2.92	□□□□□ -1.94
VAR1	P02381	RPS7A	YOR096W	573 nt		2.92	□□□□□ -1.94
VAR1	P02381	PZF1	YPR186C	1290 nt		2.92	□□□□□ -1.94
VAR1	P02381	CKS1	YBR135W	453 nt		2.92	□□□□□ -1.94
VAR1	P02381	SSE2	YBR169C	2082 nt		2.92	□□□□□ -1.94
VAR1	P02381	OSH3	YHR073W	2991 nt		2.92	□□□□□ -1.94
VAR1	P02381	CIT1	YNR001C	1440 nt		2.92	□□□□□ -1.94
VAR1	P02381	YOL019W	YOL019W	1656 nt		2.92	□□□□□ -1.94
VAR1	P02381	PHO87	YCR037C	2772 nt		2.91	□□□□□ -1.94
VAR1	P02381	MAG1	YER142C	891 nt		2.91	□□□□□ -1.94
VAR1	P02381	RPS28B	YLR264W	204 nt		2.91	□□□□□ -1.94
VAR1	P02381	MVD1	YNR043W	1191 nt		2.91	□□□□□ -1.94
VAR1	P02381	FDH1	YOR388C	1131 nt		2.91	□□□□□ -1.94
VAR1	P02381	SMI1	YGR229C	1518 nt		2.91	□□□□□ -1.94
VAR1	P02381	KIN4	YOR233W	2403 nt		2.91	□□□□□ -1.94
VAR1	P02381	CLB4	YLR210W	1383 nt		2.9	□□□□□ -1.94
VAR1	P02381	SIP1	YDR422C	2448 nt		2.9	□□□□□ -1.94
VAR1	P02381	YCR050C	YCR050C	309 nt		2.9	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	HOM2	YDR158W	1098 nt		2.9	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	TRP4	YDR354W	1143 nt		2.9	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	SPT3	YDR392W	1014 nt		2.9	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	YGR139W	YGR139W	339 nt		2.9	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	YHR032C-A	YHR032C-A	120 nt		2.9	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	YNL181W	YNL181W	1224 nt		2.9	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	VAM10	YOR068C	345 nt		2.9	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	ERG9	YHR190W	1335 nt		2.9	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	PRP40	YKL012W	1752 nt		2.89	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	LCB5	YLR260W	2064 nt		2.89	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	RAD57	YDR004W	1383 nt		2.89	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	HST1	YOL068C	1512 nt		2.89	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	ENA2	YDR039C	3276 nt		2.89	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	ENA1	YDR040C	3276 nt		2.89	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	GLC3	YEL011W	2115 nt		2.89	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	ARP10	YDR106W	855 nt		2.89	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	AHA1	YDR214W	1053 nt		2.89	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	IRC22	YEL001C	678 nt		2.89	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	FAR8	YMR029C	1572 nt		2.89	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	MTF1	YMR228W	1026 nt		2.89	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	CWC25	YNL245C	540 nt		2.89	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	FRE4	YNR060W	2160 nt		2.89	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	RSC1	YGR056W	2787 nt		2.89	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	PUB1	YNL016W	1362 nt		2.88	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	SPO1	YNL012W	1896 nt		2.88	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	FAS1	YKL182W	6156 nt		2.88	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	AAD3	YCR107W	1092 nt		2.88	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	YEL009C-A	YEL009C-A	408 nt		2.88	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	SEC53	YFL045C	765 nt		2.88	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	COS6	YGR295C	1146 nt		2.88	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	YKL162C-A	YKL162C-A	153 nt		2.88	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	YAL064W-B	YAL064W-B	381 nt		2.88	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	YBL010C	YBL010C	843 nt		2.88	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	YMR086C-A	YMR086C-A	339 nt		2.88	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	PHA2	YNL316C	1005 nt		2.88	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	EKI1	YDR147W	1605 nt		2.88	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	NRP1	YDL167C	2160 nt		2.88	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	SET1	YHR119W	3243 nt		2.88	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	ARO9	YHR137W	1542 nt		2.88	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	YPS7	YDR349C	1791 nt		2.87	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	NAT1	YDL040C	2565 nt		2.87	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	NUP85	YJR042W	2235 nt		2.87	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	FAD1	YDL045C	921 nt		2.87	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	YER067C-A	YER067C-A	324 nt		2.87	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	USE1	YGL098W	738 nt		2.87	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	YGR051C	YGR051C	324 nt		2.87	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	POG1	YIL122W	1056 nt		2.87	□□□□□ -1.95

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