Protein–RNA interactions for Protein: C9J798

RASA4B, Ras GTPase-activating protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA4BC9J798 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RASA4BC9J798 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RASA4BC9J798 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RASA4BC9J798 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RASA4BC9J798 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RASA4BC9J798 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RASA4BC9J798 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RASA4BC9J798 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RASA4BC9J798 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RASA4BC9J798 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RASA4BC9J798 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RASA4BC9J798 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RASA4BC9J798 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RASA4BC9J798 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RASA4BC9J798 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RASA4BC9J798 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RASA4BC9J798 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RASA4BC9J798 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RASA4BC9J798 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RASA4BC9J798 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RASA4BC9J798 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RASA4BC9J798 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RASA4BC9J798 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RASA4BC9J798 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RASA4BC9J798 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RASA4BC9J798 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RASA4BC9J798 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RASA4BC9J798 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RASA4BC9J798 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RASA4BC9J798 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RASA4BC9J798 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RASA4BC9J798 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RASA4BC9J798 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RASA4BC9J798 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RASA4BC9J798 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RASA4BC9J798 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RASA4BC9J798 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RASA4BC9J798 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RASA4BC9J798 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RASA4BC9J798 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RASA4BC9J798 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RASA4BC9J798 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RASA4BC9J798 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RASA4BC9J798 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RASA4BC9J798 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RASA4BC9J798 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RASA4BC9J798 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RASA4BC9J798 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RASA4BC9J798 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RASA4BC9J798 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RASA4BC9J798 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RASA4BC9J798 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RASA4BC9J798 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RASA4BC9J798 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RASA4BC9J798 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RASA4BC9J798 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RASA4BC9J798 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RASA4BC9J798 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RASA4BC9J798 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RASA4BC9J798 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RASA4BC9J798 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RASA4BC9J798 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RASA4BC9J798 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RASA4BC9J798 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RASA4BC9J798 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RASA4BC9J798 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RASA4BC9J798 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RASA4BC9J798 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RASA4BC9J798 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RASA4BC9J798 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RASA4BC9J798 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RASA4BC9J798 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RASA4BC9J798 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RASA4BC9J798 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RASA4BC9J798 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RASA4BC9J798 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RASA4BC9J798 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RASA4BC9J798 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RASA4BC9J798 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RASA4BC9J798 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RASA4BC9J798 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RASA4BC9J798 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RASA4BC9J798 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RASA4BC9J798 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RASA4BC9J798 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RASA4BC9J798 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RASA4BC9J798 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RASA4BC9J798 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RASA4BC9J798 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RASA4BC9J798 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RASA4BC9J798 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RASA4BC9J798 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RASA4BC9J798 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RASA4BC9J798 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RASA4BC9J798 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RASA4BC9J798 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RASA4BC9J798 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RASA4BC9J798 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RASA4BC9J798 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RASA4BC9J798 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms