Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP59

SLC40A1, Solute carrier family 40 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC40A1Q9NP59 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC40A1Q9NP59 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC40A1Q9NP59 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.6 ms