Protein–RNA interactions for Protein: Q92622

RUBCN, Run domain Beclin-1-interacting and cysteine-rich domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUBCNQ92622 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUBCNQ92622 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUBCNQ92622 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUBCNQ92622 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUBCNQ92622 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUBCNQ92622 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUBCNQ92622 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUBCNQ92622 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUBCNQ92622 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUBCNQ92622 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RUBCNQ92622 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RUBCNQ92622 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RUBCNQ92622 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RUBCNQ92622 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RUBCNQ92622 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RUBCNQ92622 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RUBCNQ92622 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RUBCNQ92622 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RUBCNQ92622 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RUBCNQ92622 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RUBCNQ92622 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUBCNQ92622 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUBCNQ92622 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUBCNQ92622 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUBCNQ92622 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUBCNQ92622 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUBCNQ92622 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUBCNQ92622 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUBCNQ92622 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUBCNQ92622 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUBCNQ92622 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUBCNQ92622 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUBCNQ92622 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RUBCNQ92622 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUBCNQ92622 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUBCNQ92622 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUBCNQ92622 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUBCNQ92622 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUBCNQ92622 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUBCNQ92622 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUBCNQ92622 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUBCNQ92622 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUBCNQ92622 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUBCNQ92622 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUBCNQ92622 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RUBCNQ92622 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUBCNQ92622 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUBCNQ92622 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUBCNQ92622 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUBCNQ92622 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUBCNQ92622 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUBCNQ92622 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUBCNQ92622 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RUBCNQ92622 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUBCNQ92622 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUBCNQ92622 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUBCNQ92622 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUBCNQ92622 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUBCNQ92622 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUBCNQ92622 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUBCNQ92622 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RUBCNQ92622 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUBCNQ92622 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUBCNQ92622 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUBCNQ92622 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUBCNQ92622 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUBCNQ92622 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUBCNQ92622 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUBCNQ92622 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUBCNQ92622 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUBCNQ92622 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUBCNQ92622 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUBCNQ92622 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUBCNQ92622 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUBCNQ92622 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUBCNQ92622 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUBCNQ92622 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUBCNQ92622 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUBCNQ92622 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RUBCNQ92622 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUBCNQ92622 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms