Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYE1

CCDC13, Coiled-coil domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC13Q8IYE1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC13Q8IYE1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms