Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GNB1P62873 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GNB1P62873 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNB1P62873 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNB1P62873 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNB1P62873 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNB1P62873 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GNB1P62873 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNB1P62873 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNB1P62873 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNB1P62873 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNB1P62873 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNB1P62873 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNB1P62873 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNB1P62873 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNB1P62873 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNB1P62873 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNB1P62873 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNB1P62873 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNB1P62873 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNB1P62873 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNB1P62873 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNB1P62873 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNB1P62873 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNB1P62873 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNB1P62873 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GNB1P62873 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GNB1P62873 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GNB1P62873 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GNB1P62873 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GNB1P62873 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GNB1P62873 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GNB1P62873 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GNB1P62873 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GNB1P62873 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GNB1P62873 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GNB1P62873 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GNB1P62873 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GNB1P62873 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GNB1P62873 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GNB1P62873 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GNB1P62873 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GNB1P62873 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GNB1P62873 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GNB1P62873 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GNB1P62873 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GNB1P62873 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GNB1P62873 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GNB1P62873 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GNB1P62873 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GNB1P62873 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GNB1P62873 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GNB1P62873 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GNB1P62873 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GNB1P62873 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GNB1P62873 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GNB1P62873 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GNB1P62873 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GNB1P62873 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GNB1P62873 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GNB1P62873 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GNB1P62873 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GNB1P62873 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GNB1P62873 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GNB1P62873 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GNB1P62873 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GNB1P62873 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GNB1P62873 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GNB1P62873 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GNB1P62873 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GNB1P62873 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GNB1P62873 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GNB1P62873 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GNB1P62873 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
GNB1P62873 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GNB1P62873 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GNB1P62873 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GNB1P62873 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
GNB1P62873 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GNB1P62873 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GNB1P62873 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GNB1P62873 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GNB1P62873 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GNB1P62873 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GNB1P62873 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GNB1P62873 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GNB1P62873 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GNB1P62873 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GNB1P62873 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GNB1P62873 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GNB1P62873 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GNB1P62873 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GNB1P62873 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GNB1P62873 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GNB1P62873 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GNB1P62873 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GNB1P62873 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GNB1P62873 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GNB1P62873 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GNB1P62873 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 212.7 ms