Protein–RNA interactions for Protein: P53999

SUB1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SUB1P53999 HEPH-201ENST00000336279 4228 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.342e-9■■■■■ 32.1
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SUB1P53999 NDUFS5-202ENST00000372969 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.85e-19■■■■■ 31.7
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SUB1P53999 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.211e-6■■■■■ 31.6
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SUB1P53999 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.381e-6■■■■■ 31.6
SUB1P53999 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.431e-6■■■■■ 31.6
SUB1P53999 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.431e-6■■■■■ 31.6
SUB1P53999 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.431e-6■■■■■ 31.6
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