Protein–RNA interactions for Protein: P38316

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, yeast

Predictions only

Length 186 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG12	P38316	CYC1	YJR048W	330 nt		3.89	□□□□□ -1.79
ATG12	P38316	KTR2	YKR061W	1278 nt		3.89	□□□□□ -1.79
ATG12	P38316	YLR124W	YLR124W	345 nt		3.89	□□□□□ -1.79
ATG12	P38316	NRK1	YNL129W	723 nt		3.89	□□□□□ -1.79
ATG12	P38316	SET4	YJL105W	1683 nt		3.89	□□□□□ -1.79
ATG12	P38316	PPQ1	YPL179W	1650 nt		3.89	□□□□□ -1.79
ATG12	P38316	ORC6	YHR118C	1308 nt		3.89	□□□□□ -1.79
ATG12	P38316	FKH1	YIL131C	1455 nt		3.88	□□□□□ -1.79
ATG12	P38316	RPS14A	YCR031C	414 nt		3.88	□□□□□ -1.79
ATG12	P38316	AAD3	YCR107W	1092 nt		3.88	□□□□□ -1.79
ATG12	P38316	BCP1	YDR361C	852 nt		3.88	□□□□□ -1.79
ATG12	P38316	YGL063C-A	YGL063C-A	150 nt		3.88	□□□□□ -1.79
ATG12	P38316	YIL163C	YIL163C	354 nt		3.88	□□□□□ -1.79
ATG12	P38316	ELF1	YKL160W	438 nt		3.88	□□□□□ -1.79
ATG12	P38316	UTP23	YOR004W	765 nt		3.88	□□□□□ -1.79
ATG12	P38316	YPL073C	YPL073C	486 nt		3.88	□□□□□ -1.79
ATG12	P38316	COA2	YPL189C-A	207 nt		3.88	□□□□□ -1.79
ATG12	P38316	ISA2	YPR067W	558 nt		3.88	□□□□□ -1.79
ATG12	P38316	ECM22	YLR228C	2445 nt		3.87	□□□□□ -1.79
ATG12	P38316	CDC14	YFR028C	1656 nt		3.87	□□□□□ -1.79
ATG12	P38316	MLH2	YLR035C	2088 nt		3.87	□□□□□ -1.79
ATG12	P38316	YGL262W	YGL262W	528 nt		3.87	□□□□□ -1.79
ATG12	P38316	YMR147W	YMR147W	672 nt		3.87	□□□□□ -1.79
ATG12	P38316	YOR008W-B	YOR008W-B	102 nt		3.87	□□□□□ -1.79
ATG12	P38316	YPR150W	YPR150W	522 nt		3.87	□□□□□ -1.79
ATG12	P38316	LRG1	YDL240W	3054 nt		3.87	□□□□□ -1.79
ATG12	P38316	BIK1	YCL029C	1323 nt		3.87	□□□□□ -1.79
ATG12	P38316	DIP2	YLR129W	2832 nt		3.87	□□□□□ -1.79
ATG12	P38316	GAS2	YLR343W	1668 nt		3.87	□□□□□ -1.79
ATG12	P38316	VPS36	YLR417W	1701 nt		3.87	□□□□□ -1.79
ATG12	P38316	PHO12	YHR215W	1404 nt		3.87	□□□□□ -1.79
ATG12	P38316	PHO11	YAR071W	1404 nt		3.87	□□□□□ -1.79
ATG12	P38316	DHH1	YDL160C	1521 nt		3.86	□□□□□ -1.79
ATG12	P38316	RRN11	YML043C	1524 nt		3.86	□□□□□ -1.79
ATG12	P38316	IMG2	YCR071C	441 nt		3.86	□□□□□ -1.79
ATG12	P38316	YOL019W-A	YOL019W-A	153 nt		3.86	□□□□□ -1.79
ATG12	P38316	ARO7	YPR060C	771 nt		3.86	□□□□□ -1.79
ATG12	P38316	GAC1	YOR178C	2382 nt		3.85	□□□□□ -1.79
ATG12	P38316	RPS11A	YDR025W	471 nt		3.85	□□□□□ -1.79
ATG12	P38316	YER034W	YER034W	558 nt		3.85	□□□□□ -1.79
ATG12	P38316	YER076C	YER076C	909 nt		3.85	□□□□□ -1.79
ATG12	P38316	BNA1	YJR025C	534 nt		3.85	□□□□□ -1.79
ATG12	P38316	COX19	YLL018C-A	297 nt		3.85	□□□□□ -1.79
ATG12	P38316	YMR315W	YMR315W	1050 nt		3.85	□□□□□ -1.79
ATG12	P38316	HOS2	YGL194C	1359 nt		3.85	□□□□□ -1.79
ATG12	P38316	SSU1	YPL092W	1377 nt		3.85	□□□□□ -1.79
ATG12	P38316	YDL124W	YDL124W	939 nt		3.84	□□□□□ -1.79
ATG12	P38316	AIM26	YKL037W	357 nt		3.84	□□□□□ -1.79
ATG12	P38316	MBR1	YKL093W	1020 nt		3.84	□□□□□ -1.79
ATG12	P38316	YLR049C	YLR049C	1287 nt		3.84	□□□□□ -1.79
ATG12	P38316	MFM1	YPL060W	1242 nt		3.84	□□□□□ -1.79
ATG12	P38316	ROD1	YOR018W	2514 nt		3.84	□□□□□ -1.8
ATG12	P38316	GGA1	YDR358W	1674 nt		3.84	□□□□□ -1.8
ATG12	P38316	MRH4	YGL064C	1686 nt		3.84	□□□□□ -1.8
ATG12	P38316	FAT1	YBR041W	2010 nt		3.83	□□□□□ -1.8
ATG12	P38316	PFK1	YGR240C	2964 nt		3.83	□□□□□ -1.8
ATG12	P38316	DAS2	YDR020C	699 nt		3.83	□□□□□ -1.8
ATG12	P38316	YDR274C	YDR274C	372 nt		3.83	□□□□□ -1.8
ATG12	P38316	YEL074W	YEL074W	339 nt		3.83	□□□□□ -1.8
ATG12	P38316	YGL108C	YGL108C	423 nt		3.83	□□□□□ -1.8
ATG12	P38316	SNO1	YMR095C	675 nt		3.83	□□□□□ -1.8
ATG12	P38316	GLO4	YOR040W	858 nt		3.83	□□□□□ -1.8
ATG12	P38316	MRS2	YOR334W	1413 nt		3.83	□□□□□ -1.8
ATG12	P38316	PDR5	YOR153W	4536 nt		3.83	□□□□□ -1.8
ATG12	P38316	PPZ1	YML016C	2079 nt		3.83	□□□□□ -1.8
ATG12	P38316	ECM16	YMR128W	3804 nt		3.83	□□□□□ -1.8
ATG12	P38316	YGR027W-B	YGR027W-B	5268 nt		3.82	□□□□□ -1.8
ATG12	P38316	YLR227W-B	YLR227W-B	5268 nt		3.82	□□□□□ -1.8
ATG12	P38316	YPR158C-D	YPR158C-D	5268 nt		3.82	□□□□□ -1.8
ATG12	P38316	GLN4	YOR168W	2430 nt		3.82	□□□□□ -1.8
ATG12	P38316	NOG1	YPL093W	1944 nt		3.82	□□□□□ -1.8
ATG12	P38316	LPP1	YDR503C	825 nt		3.82	□□□□□ -1.8
ATG12	P38316	REC104	YHR157W	549 nt		3.82	□□□□□ -1.8
ATG12	P38316	RPB3	YIL021W	957 nt		3.82	□□□□□ -1.8
ATG12	P38316	MRS3	YJL133W	945 nt		3.82	□□□□□ -1.8
ATG12	P38316	YRA2	YKL214C	612 nt		3.82	□□□□□ -1.8
ATG12	P38316	IMP1	YMR150C	573 nt		3.82	□□□□□ -1.8
ATG12	P38316	SET6	YPL165C	1122 nt		3.82	□□□□□ -1.8
ATG12	P38316	YBR219C	YBR219C	384 nt		3.82	□□□□□ -1.8
ATG12	P38316	TFA1	YKL028W	1449 nt		3.81	□□□□□ -1.8
ATG12	P38316	FMP30	YPL103C	1407 nt		3.81	□□□□□ -1.8
ATG12	P38316	RRP1	YDR087C	837 nt		3.81	□□□□□ -1.8
ATG12	P38316	YDR161W	YDR161W	1164 nt		3.81	□□□□□ -1.8
ATG12	P38316	ORM2	YLR350W	651 nt		3.81	□□□□□ -1.8
ATG12	P38316	URA4	YLR420W	1095 nt		3.81	□□□□□ -1.8
ATG12	P38316	SIR1	YKR101W	1965 nt		3.81	□□□□□ -1.8
ATG12	P38316	AVT1	YJR001W	1809 nt		3.81	□□□□□ -1.8
ATG12	P38316	APM1	YPL259C	1428 nt		3.8	□□□□□ -1.8
ATG12	P38316	MDM34	YGL219C	1380 nt		3.8	□□□□□ -1.8
ATG12	P38316	YMR084W	YMR084W	789 nt		3.8	□□□□□ -1.8
ATG12	P38316	MDM12	YOL009C	816 nt		3.8	□□□□□ -1.8
ATG12	P38316	PUT2	YHR037W	1728 nt		3.8	□□□□□ -1.8
ATG12	P38316	CEX1	YOR112W	2286 nt		3.79	□□□□□ -1.8
ATG12	P38316	ARX1	YDR101C	1782 nt		3.79	□□□□□ -1.8
ATG12	P38316	VPS53	YJL029C	2469 nt		3.79	□□□□□ -1.8
ATG12	P38316	DSD1	YGL196W	1287 nt		3.79	□□□□□ -1.8
ATG12	P38316	ERG5	YMR015C	1617 nt		3.79	□□□□□ -1.8
ATG12	P38316	DBP3	YGL078C	1572 nt		3.79	□□□□□ -1.8
ATG12	P38316	GIP4	YAL031C	2283 nt		3.79	□□□□□ -1.8
ATG12	P38316	GPI13	YLL031C	3054 nt		3.79	□□□□□ -1.8

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