Protein–RNA interactions for Protein: P22748

CA4, Carbonic anhydrase 4, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA4P22748 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CA4P22748 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CA4P22748 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CA4P22748 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CA4P22748 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CA4P22748 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CA4P22748 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CA4P22748 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CA4P22748 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CA4P22748 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CA4P22748 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CA4P22748 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CA4P22748 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CA4P22748 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CA4P22748 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CA4P22748 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CA4P22748 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CA4P22748 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CA4P22748 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CA4P22748 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CA4P22748 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CA4P22748 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CA4P22748 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CA4P22748 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CA4P22748 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CA4P22748 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CA4P22748 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CA4P22748 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CA4P22748 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CA4P22748 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CA4P22748 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CA4P22748 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CA4P22748 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CA4P22748 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CA4P22748 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CA4P22748 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CA4P22748 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CA4P22748 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CA4P22748 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CA4P22748 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CA4P22748 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CA4P22748 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CA4P22748 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CA4P22748 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CA4P22748 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CA4P22748 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CA4P22748 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CA4P22748 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CA4P22748 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CA4P22748 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CA4P22748 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CA4P22748 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CA4P22748 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CA4P22748 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CA4P22748 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CA4P22748 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CA4P22748 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CA4P22748 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CA4P22748 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CA4P22748 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CA4P22748 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CA4P22748 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CA4P22748 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CA4P22748 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CA4P22748 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CA4P22748 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CA4P22748 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CA4P22748 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CA4P22748 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CA4P22748 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CA4P22748 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CA4P22748 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CA4P22748 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CA4P22748 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CA4P22748 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CA4P22748 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CA4P22748 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CA4P22748 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CA4P22748 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CA4P22748 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CA4P22748 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CA4P22748 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CA4P22748 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CA4P22748 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CA4P22748 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CA4P22748 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CA4P22748 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CA4P22748 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CA4P22748 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CA4P22748 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CA4P22748 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CA4P22748 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CA4P22748 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CA4P22748 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CA4P22748 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CA4P22748 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CA4P22748 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CA4P22748 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CA4P22748 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CA4P22748 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.5 ms