Protein–RNA interactions for Protein: P13473

LAMP2, Lysosome-associated membrane glycoprotein 2, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP2P13473 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMP2P13473 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMP2P13473 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMP2P13473 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMP2P13473 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMP2P13473 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMP2P13473 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMP2P13473 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMP2P13473 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMP2P13473 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMP2P13473 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMP2P13473 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMP2P13473 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMP2P13473 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMP2P13473 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMP2P13473 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMP2P13473 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMP2P13473 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMP2P13473 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMP2P13473 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMP2P13473 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMP2P13473 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMP2P13473 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMP2P13473 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMP2P13473 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMP2P13473 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMP2P13473 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMP2P13473 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMP2P13473 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMP2P13473 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMP2P13473 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMP2P13473 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMP2P13473 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMP2P13473 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMP2P13473 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMP2P13473 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMP2P13473 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMP2P13473 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMP2P13473 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMP2P13473 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMP2P13473 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMP2P13473 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMP2P13473 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMP2P13473 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMP2P13473 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMP2P13473 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMP2P13473 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMP2P13473 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMP2P13473 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMP2P13473 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMP2P13473 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMP2P13473 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMP2P13473 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMP2P13473 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMP2P13473 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LAMP2P13473 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LAMP2P13473 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LAMP2P13473 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMP2P13473 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMP2P13473 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMP2P13473 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMP2P13473 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMP2P13473 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMP2P13473 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMP2P13473 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMP2P13473 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMP2P13473 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMP2P13473 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMP2P13473 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMP2P13473 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMP2P13473 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMP2P13473 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMP2P13473 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMP2P13473 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMP2P13473 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMP2P13473 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMP2P13473 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMP2P13473 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMP2P13473 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMP2P13473 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMP2P13473 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMP2P13473 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMP2P13473 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMP2P13473 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMP2P13473 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMP2P13473 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMP2P13473 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMP2P13473 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMP2P13473 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMP2P13473 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMP2P13473 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMP2P13473 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMP2P13473 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMP2P13473 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMP2P13473 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMP2P13473 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMP2P13473 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMP2P13473 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMP2P13473 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMP2P13473 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.7 ms