Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB6O95452 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB6O95452 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB6O95452 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB6O95452 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB6O95452 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB6O95452 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB6O95452 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB6O95452 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB6O95452 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB6O95452 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB6O95452 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB6O95452 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB6O95452 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB6O95452 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB6O95452 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB6O95452 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB6O95452 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB6O95452 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB6O95452 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB6O95452 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB6O95452 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB6O95452 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB6O95452 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB6O95452 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB6O95452 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB6O95452 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB6O95452 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB6O95452 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB6O95452 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB6O95452 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB6O95452 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB6O95452 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB6O95452 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB6O95452 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB6O95452 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB6O95452 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB6O95452 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB6O95452 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB6O95452 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB6O95452 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB6O95452 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB6O95452 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB6O95452 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB6O95452 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB6O95452 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB6O95452 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB6O95452 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB6O95452 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB6O95452 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB6O95452 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB6O95452 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB6O95452 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB6O95452 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB6O95452 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB6O95452 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB6O95452 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB6O95452 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB6O95452 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB6O95452 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB6O95452 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB6O95452 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB6O95452 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB6O95452 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB6O95452 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB6O95452 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB6O95452 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB6O95452 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB6O95452 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB6O95452 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB6O95452 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB6O95452 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB6O95452 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB6O95452 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB6O95452 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB6O95452 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB6O95452 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB6O95452 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB6O95452 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB6O95452 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB6O95452 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB6O95452 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB6O95452 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB6O95452 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB6O95452 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB6O95452 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB6O95452 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB6O95452 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB6O95452 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB6O95452 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB6O95452 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB6O95452 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB6O95452 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB6O95452 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB6O95452 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB6O95452 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB6O95452 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB6O95452 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB6O95452 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB6O95452 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms