Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC7A4O43246 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC7A4O43246 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC7A4O43246 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC7A4O43246 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC7A4O43246 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC7A4O43246 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC7A4O43246 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC7A4O43246 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC7A4O43246 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC7A4O43246 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC7A4O43246 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC7A4O43246 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC7A4O43246 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC7A4O43246 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC7A4O43246 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC7A4O43246 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC7A4O43246 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC7A4O43246 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC7A4O43246 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC7A4O43246 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC7A4O43246 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC7A4O43246 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC7A4O43246 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC7A4O43246 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC7A4O43246 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC7A4O43246 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC7A4O43246 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC7A4O43246 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC7A4O43246 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC7A4O43246 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC7A4O43246 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC7A4O43246 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC7A4O43246 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC7A4O43246 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC7A4O43246 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC7A4O43246 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC7A4O43246 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC7A4O43246 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC7A4O43246 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC7A4O43246 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC7A4O43246 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC7A4O43246 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC7A4O43246 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC7A4O43246 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC7A4O43246 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC7A4O43246 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC7A4O43246 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC7A4O43246 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC7A4O43246 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC7A4O43246 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC7A4O43246 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC7A4O43246 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC7A4O43246 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC7A4O43246 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC7A4O43246 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC7A4O43246 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC7A4O43246 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC7A4O43246 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC7A4O43246 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC7A4O43246 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC7A4O43246 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC7A4O43246 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.1 ms