Protein–RNA interactions for Protein: O15254

ACOX3, Peroxisomal acyl-coenzyme A oxidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACOX3O15254 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACOX3O15254 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACOX3O15254 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACOX3O15254 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACOX3O15254 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACOX3O15254 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACOX3O15254 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACOX3O15254 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACOX3O15254 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACOX3O15254 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACOX3O15254 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACOX3O15254 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACOX3O15254 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACOX3O15254 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACOX3O15254 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACOX3O15254 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACOX3O15254 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACOX3O15254 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACOX3O15254 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACOX3O15254 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACOX3O15254 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACOX3O15254 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACOX3O15254 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ACOX3O15254 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACOX3O15254 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACOX3O15254 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ACOX3O15254 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACOX3O15254 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ACOX3O15254 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACOX3O15254 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACOX3O15254 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACOX3O15254 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACOX3O15254 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACOX3O15254 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACOX3O15254 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACOX3O15254 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACOX3O15254 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACOX3O15254 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACOX3O15254 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACOX3O15254 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACOX3O15254 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACOX3O15254 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACOX3O15254 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACOX3O15254 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACOX3O15254 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACOX3O15254 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACOX3O15254 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACOX3O15254 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACOX3O15254 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms