Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKU0

ACSL6, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 6, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL6Q9UKU0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACSL6Q9UKU0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACSL6Q9UKU0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACSL6Q9UKU0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACSL6Q9UKU0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACSL6Q9UKU0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACSL6Q9UKU0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACSL6Q9UKU0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACSL6Q9UKU0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACSL6Q9UKU0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACSL6Q9UKU0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ACSL6Q9UKU0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACSL6Q9UKU0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSL6Q9UKU0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSL6Q9UKU0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSL6Q9UKU0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSL6Q9UKU0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSL6Q9UKU0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSL6Q9UKU0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSL6Q9UKU0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSL6Q9UKU0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSL6Q9UKU0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSL6Q9UKU0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSL6Q9UKU0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSL6Q9UKU0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSL6Q9UKU0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSL6Q9UKU0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSL6Q9UKU0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSL6Q9UKU0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSL6Q9UKU0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSL6Q9UKU0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSL6Q9UKU0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSL6Q9UKU0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms