Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
VPREB3Q9UKI3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
VPREB3Q9UKI3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1040.3 ms